مقایسه میزان هوموزیگوسیتی در جایگاه های SNP و ROH در گاوهای شیری پر تولید و کم تولید هلشتاین

سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 394

فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد

این مقاله در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این مقاله:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJAS-50-3_008

تاریخ نمایه سازی: 6 خرداد 1399

چکیده مقاله:

افزایش هوموزیگوسیتی حاصل از آمیزش حیوانات خویشاوند، به­عنوان یکی از چالش­های فرا روی صنعت پرورش گاو شیری می­باشد که توجه زیادی را به خود جلب کرده است. پژوهش حاضر به ­منظور بررسی هوموزیگوسیتی بر مبنای جایگاه­های SNP و ROH در دام­های پر ­تولید و کم ­تولید هلشتاین انجام شده است. در این مطالعه، برای تعیین حیوانات کاندیدا برای تعیین ژنوتیپ از دو رویکرد تابعیت تصادفی و شاخص شجره­ای استفاده شد. برای این منظور، نمونه­گیری از 150 راس گاو شیری (75 دام با ارزش اصلاحی بالا و 75 دام با ارزش اصلاحی پایین برای صفت تولید شیر) انجام شد. یک روش بهینه به­ منظور انتخاب حیوانات کاندیدا برای تعیین ژنوتیپ، از طریق تلفیق برآوردهای حاصل از تابعیت تصادفی و شاخص شجره­ای ارائه گردید. ارزش­های اصلاحی ژنومی برای دو گروه نشان داد که تاکید بر افزایش سطح تولید در دام­های پر تولید، اثر منفی بر روی صفات مرتبط با باروری (55/0- = DPR) و طول­عمر تولیدی (1/0=PL) داشته است. همچنین، میزان هوموزیگوسیتی بر مبنای ROH دامنه­ای از تغییرات را برای کروموزوم­های مختلف در دام­های با سطح تولید بالا و پایین نشان داد که ممکن است با تفاوت در سطح تولید این دو گروه و پراکنش غیر یکنواخت ژن­های موثر بر میزان تولید بر روی کروموزوم­های مختلف در ارتباط باشد.

نویسندگان

حجت اله موسی پور

دانشجوی دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج

اردشیر نجاتی جوارمی

استاد، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج

محمد مرادی شهربابک

استاد، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج

مهدی ساعتچی

استادیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه ایالتی آیووا، ایالات متحده امریکا

مراجع و منابع این مقاله:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این مقاله را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود مقاله لینک شده اند :
  • Bjelland, D., Weigel, K., Vukasinovic, N. & Nkrumah, J. (2013). ...
  • Boichard, D. & Brochard, M. (2012). New phenotypes for new ...
  • Boichard, D., Ducrocq, V. & Fritz, S. (2015). Sustainable dairy ...
  • Curik, I., Ferenčaković, M. & Sölkner, J. (2014). Inbreeding and ...
  • García-Ruiz, A., Cole, J.B., VanRaden, P.M., Wiggans, G.R., Ruiz-López, F.J. ...
  • Hayes, B.J., Lien, S., Nilsen, H., Olsen, H.G., Berg, P., ...
  • Henryon, M., Berg, P. & Sørensen, A.C. (2014). Animal-breeding schemes ...
  • Hill, W.G. & Kirkpatrick, M. (2010). What animal breeding has ...
  • Hill, W.G. & Weir, B. (2011). Variation in actual relationship ...
  • Ismael, A., Strandberg, E., Berglund, B., Kargo, M., Fogh, A. ...
  • Keller, M.C., Visscher, P.M. & Goddard, M.E. (2011). Quantification of ...
  • Kim, E.-S., Cole, J.B., Huson, H., Wiggans, G.R., Van Tassell, ...
  • Lagerkvist, G., Johansson, K. & Lundeheim, N. (1994). Selection for ...
  • Leroy, G., Mary-Huard, T., Verrier, E., Danvy, S., Charvolin, E. ...
  • MacArthur, D.G., Balasubramanian, S., Frankish, A., Huang, N., Morris, J., ...
  • Marras, G., Gaspa, G., Sorbolini, S., Dimauro, C., Ajmone‐Marsan, P., ...
  • McQuillan, R., Leutenegger, A.-L., Abdel-Rahman, R., Franklin, C.S., Pericic, M., ...
  • Pryce, J., Hayes, B. & Goddard, M. (2012). Novel strategies ...
  • Pryce, J., Royal, M., Garnsworthy, P. & Mao, I.L. (2004). ...
  • Purcell, S., Neale, B., Todd-Brown, K., Thomas, L., Ferreira, M.A., ...
  • Purfield, D.C., Berry, D.P., McParland, S. & Bradley, D.G. (2012). ...
  • Rokouei, M., Torshizi, R.V., Shahrbabak, M.M., Sargolzaei, M. & Sørensen, ...
  • Smith, L.A., Cassell, B. & Pearson, R. (1998). The effects ...
  • Sonesson, A. & Woolliams, J. (2010). Maximising genetic gain whilst ...
  • Su, G., Madsen, P., Nielsen, U.S., Mäntysaari, E.A., Aamand, G.P., ...
  • Team, R.C. (2014). R: A language and environment for statistical ...
  • Walsh, S., Williams, E. & Evans, A. (2011). A review ...
  • Wiggans, G., VanRaden, P. & Zuurbier, J. (1995). Calculation and ...
  • نمایش کامل مراجع