شناسایی microRNA (miRNA)ها و ژن های هدف آن ها در دو گونه Cichorium intybus و Cichorium endivia
سال انتشار: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 260
فایل این مقاله در 10 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_IJFCS-52-3_001
تاریخ نمایه سازی: 2 بهمن 1400
چکیده مقاله:
miRNAها مجموعهای از مولکولهای کوچک RNA غیرکد کننده و درونزاد، با طول حدود ۲۲ نوکلئوتید هستند که در تنظیم پس از رونویسی از طریق تخریب mRNAهای هدف و یا سرکوب ترجمه آن ها، نقش دارند. این مولکولها به صورت تکاملی در قلمرو گیاهی حفاظت شده هستند؛ از این رو، با استفاده از ابزارها و روشهای مقایسهای میتوان آن ها و همچنین ژنهای هدف آن ها را پیشگویی کرد. در مطالعه حاضر، از روشهای بیوانفورماتیکی و آزمایشگاهی و همچنین توالیهای EST دو گونه کاسنی و miRNA موجود در بانکهای اطلاعاتی، جهت شناسایی miRNAها و ژنهای هدف آن ها در دو گونه C. intybus و C. endivia استفاده شد. این توالیها در ابتدا Blastn شدند و در نهایت و پس از طی مراحل مختلف، چهار miRNA متعلق به خانوادههای miR۱۶۶، miR۱۶۲، miR۱۵۶ و miR۳۹۳ شناسایی شد. همچنین تعداد زیادی ژن از جمله TIR۱، ژنهای پروتئینهای متصل شونده به پروموتر Squamusa و ... به عنوان ژنهای هدف این miRNAها شناسایی شدند. نتایج Real Time PCR نشان داد که بیان miR۱۵۶ در برگ گونه C. endivia، بیشتر از گل آن و همچنین بالاتر از بیان این miRNA در برگ و گل گونه C. intybus است.
کلیدواژه ها:
نویسندگان
محمد چهاربنیچه فرجی
دانشجو گروه زراعت و اصلاح نباتات، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
محمدرضا نقوی
استاد گروه زراعت و اصلاح نباتات، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران
منیژه سبکدست نودهی
استادیار، گروه زراعت و اصلاح نباتات، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران
جابر نصیری
استادیار پژوهشکده کشاورزی هسته ای، پژوهشگاه علوم و فنون هسته ای، سازمان انرژی اتمی ایران، کرج