بررسی مقایسه دو پروموتر R۱ و R۶ در گیاه سیب

میزان آنتوسیانین از عوامل مهمی در تعیین رنگ بسیاری از میوه ها وگل ها است. در سیب، تنوع زیادی در میزان رنگدانهآنتوسیانین در پوست و میوه مشاهده می شود. به منظور نقش عناصر تنظیمی سیس در نواحی پروموتری در دو نوع ازسیب های با میوه و پوست قرمز با پرموموتر (R(۶ و سیب های با میوه سفید با پروموتر (R(۱ در پاسخ به تنش های مختلف زیستیو غیر زیستی مورد بررسی قرار گرفت. در همن راستا توالی ۱۵۰۰ جفت باز بالادست این ژن، توالی پروموترها و عناصرتنظیمی سیس موجود در آنها با استفاده از Phytozime ، PlantCARE و PlantPAN استخراج و مورد تجزیه و تحلیل قرارگرفت. نتایج آنالیز بیوانفورماتیکی بیانگر این واقعیت است که هر دو پروموتر دارای تعداد عناصر تنظیمی متنوعی در پاسخ بهعوامل مختلف محیطی و تنش های زیستی است. هسته ی مرکزی پروموترها TATA Box و معمول ترین عنصر تنظیمی سیسCAAT Box بود. از جمله عناصر تنظیمی دیگر می توان عناصر تنظیمی مرتبط با پاسخ به نور، پاسخ به آبسزیک اسید ، دفاعدر برابر استرس زیستی و سایت اتصال MYB را نام برد. با مقایسه بین دو پروموتر نشان می دهد که علاوه بر عناصر تنظیمیسیس مشترک در پروموتر R۶ دارای ۵ توالی های تکراری به طول ۳۲bp است. این توالی ها نقش افزایش دهنده داشته و باعثافزایش سطح نسخه برداری ژن و در نهایت تجمع آنتوسیانین در گوشت میوه و پوست سیب می شود. بنابراین با مطالعه وبررسی عناصر تنظیمی پروموترها می توان کمک شایانی در برنامه های مهندسی ژنتیک جهت دست ورزی ژنتیکی در مسیربیوسنتز آنتوسیانین و افزایش میزان آن به عنوان یک رنگدانه طبیعی در صنعت غذایی نمود.

کلیدواژه ها:

آنتوسیانین ، آنالیز بیوانفورماتیکی ، عناصر تنظیمی