شناسایی گونه های تریکودرما با استفاده از توالی یابی جزیی ژن های nrRNA و tef1α همراه با معرفی Trichoderma capillare برای میکوفلور ایران
محل انتشار: فصلنامه حفاظت گیاهان، دوره: 31، شماره: 3
سال انتشار: 1398
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: فارسی
مشاهده: 518
فایل این مقاله در 12 صفحه با فرمت PDF قابل دریافت می باشد
- صدور گواهی نمایه سازی
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JPP-31-3_001
تاریخ نمایه سازی: 6 اسفند 1398
چکیده مقاله:
گونه های تریکودرما به فراوانی در خاک های کشاورزی یافت میشوند و اغلب آنها بعنوان عامل بیوکنترلی علیه بیمارگرهای گیاهی عمل می کنند. آنها همچنین بعنوان تولیدکننده های صنعتی آنزیم ها شناخته می شوند. با توجه به اهمیت این قارچ، شناسایی صحیح آن ها در سطح گونه ضروری می باشد. شناسایی گونه ها مبتنی بر خصوصیات ریخت شناسی با توجه به هموپلاسی زیاد در صفات ظاهری مناسب نمی باشد. در این تحقیق، 40 جدایه تریکودرما از استان های اصفهان، اراک و همدان با استفاده از توالی یابی جزیی ژن های nrRNA و tef1α شناسایی شد. جدایه ها در محیط PDB کشت شد و توده میسیلیومی با استفاده از کاغذ صافی جمع آوری شد. میسیلیوم ها در لیوفیلیزر خشک-انجمادی و سپس از آن استخراج DNA شد. واکنش زنجیرهای پلیمراز جهت تکثیر حدود 550 و 900 جفت باز بترتیب از نواحی ITS و tef1α با استفاده از آغازگرهای عمومی و تخصصی انجام شد. قطعات توالی های نوکلیوتیدی ITS و tef1α جدایه ها در هفت گروه گونه ای شاملT. ،T. pleuroticola ،T. capillare ،Trichoderma harzianum T. brevicompactum ،T. koningiopsis ،asperellum و T. virens توزیع شدند. درخت فیلوژنتیکی این جدایه ها با استرین های مرجع تیپ بر اساس توالی tef1α ترسیم شد که در آن خوشه بندی فیلوژنتیکی تولید شده اصالت گونه ای جدایه های مورد بررسی را تایید کرد. این اولین گزارش گونه T. capillare برای میکوفلور ایران است
کلیدواژه ها:
نویسندگان
مهدی مهرابی کوشکی
استادیار، بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز
مریم باورساد
دانش آموخته کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز
رضا فرخی نژاد
استاد بیماری شناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز